L-cisteina este utilizată în principal în medicină, cosmetică, cercetare biochimică; se folosește în materiale pentru pâine pentru a promova formarea glutenului și pentru a promova fermentația, mucegaiul și pentru a preveni îmbătrânirea. Se folosește în sucurile naturale pentru a preveni oxidarea vitaminei C și pentru a împiedica sucul să se rumenească. Produsul are efect de detoxifiere, poate fi utilizat pentru otrăvirea cu acrilonitril, acidoză aromatică.
Acetilcisteina, cunoscută și sub numele de N-acetilcisteină sau N-acetil-L-cisteină (NAC), este un medicament utilizat pentru a trata supradozajul și pentru a slăbi mucusul gros, cum ar fi fibroza chistică sau boala pulmonară obstructivă cronică.